"Журнал высшей нервной деятельности им. И.П.Павлова" публикует на русском и английском языках экспериментальные, теоретические и обзорные статьи по нейрофизиологии и патофизиологии высшей нервной деятельности человека и животных на русском и английском языках, ранее нигде не опубликованные.
В рубрике журнала «Краткие сообщения» публикуются короткие (до 10 страниц, включая список литературы и рисунки) статьи приоритетного характера; после положительной оценки двумя рецензентами и утверждения главным редактором эти статьи будут иметь преимущество по срокам опубликования.
В журнале имеются разделы: теоретические статьи; физиология высшей нервной (психической) деятельности человека; физиология поведения; обучение и память; экспериментальная патология высшей нервной деятельности; методика; обзоры и дискуссии; из истории науки; хроника; рецензии; информация.