Научно-теоретический журнал Российской академии наук "Оптика атмосферы и океана" издается с 1988 года. Основателем журнала и его главным редактором был академик В.Е. Зуев. Первоначальное название журнала "Оптика атмосферы" было изменено в 1993 году в связи с расширением тематики. Журнал издается Институтом оптики атмосферы (г. Томск), который является его соучредителем наряду с Сибирским отделением РАН. С 1989 года в полном объеме печатается и распространяется за рубежом версия журнала на английском языке. С 2009г. журнал "Atmospheric and Oceanic Optics" - версия журнала "Оптика атмосферы и океана" на английском языке - издается Pleiades Publishing Inc. и распространяется издательством Шпрингер. В год выходят шесть выпусков, которые формируются главным редактором журнала "Оптика атмосферы и океана" из статей, опубликованных в журнале на русском языке.
Тематика журнала охватывает широкий круг проблем, связанных с оптикой атмосферы и океана, экологией и климатом Земли. Это рассеяние и перенос оптических волн, спектроскопия атмосферных газов, турбулентные и нелинейные оптические явления, адаптивная оптика и т.д. Широко освещаются теоретические и экспериментальные методы исследований, среди них дистанционное (наземное, самолетное, космическое) зондирование атмосферы и подстилающей поверхности и связанные с измерениями методы решения обратных задач, а также создание аппаратуры для исследований, методов и систем их автоматизации.